文献情報
文献番号
200500677A
報告書区分
総括
研究課題名
食品由来感染症の細菌学的疫学指標のデータベース化に関する研究
課題番号
H15-新興-001
研究年度
平成17(2005)年度
研究代表者(所属機関)
寺嶋 淳(国立感染症研究所細菌第一部)
研究分担者(所属機関)
- 長野 秀樹(北海道立衛生研究所微生物)
- 甲斐 明美(東京都立衛生研究所微生物)
- 松本 昌門(愛知県衛生研究所細菌部)
- 勢戸 和子(大阪府立公衆衛生研究所感染症部)
- 田中 博(愛媛県立衛生研究所)
- 堀川 和美(福岡県保健環境研究所)
- 渡辺 治雄(国立感染症研究所細菌第一部)
研究区分
厚生労働科学研究費補助金 疾病・障害対策研究分野 新興・再興感染症研究
研究開始年度
平成15(2003)年度
研究終了予定年度
平成17(2005)年度
研究費
14,000,000円
研究者交替、所属機関変更
-
研究報告書(概要版)
研究目的
本研究では、標準化プロトコールによる種々の事例由来株の解析を行い、技術の精度を維持或いは改良することを目的とした精度管理を行う。また、国際的な広域腸管感染症事例等にも対応できるように、共通の標準化プロトコールに基づいた互換性のあるデータベースの構築を進める。分離株の解析情報を共有・還元して食品由来感染症の制御に役立てることを目的としたネットワークを構築することを目的とす。
研究方法
1) 標準化プロトコールに基づいて6ブロックごとに各種の菌についてPFGE解析を行い,その有効性の検証、および精度管理を行う。
2) 画像解析ソフト(Fingerprinting II)によるPFGE泳動像の解析を行い,感染研におけるデータベースの構築を継続するとともに、広域分離株が同一汚染原因由来であるか否かについて解析を行う。
3) 腸管出血性大腸菌O157について、Multilocus variable-number tandem repeat analysis (MLVA)法による解析条件の検討を行う。
2) 画像解析ソフト(Fingerprinting II)によるPFGE泳動像の解析を行い,感染研におけるデータベースの構築を継続するとともに、広域分離株が同一汚染原因由来であるか否かについて解析を行う。
3) 腸管出血性大腸菌O157について、Multilocus variable-number tandem repeat analysis (MLVA)法による解析条件の検討を行う。
結果と考察
各ブロック内での精度管理の結果から、基準株Salmonella Braenderup H9812株および標準化プロトコールを使用することで、より高精度の解析結果が得られデータの互換性が確保されつつあることが伺える。デンドログラムの利用により、広域共通パターンが容易に検出される一方で、PFGEによる菌株の識別能では限界があることを示唆する結果がMLVAにより得られた。今後、種々の分離株を用いてより詳細な条件検討が必要だと考えられた。解析情報を共有するための手段として、アクセスし易いInternetを利用したシステムの試験運用を行った。地研を対象とする限定公開における問題点等について、今後も検討する必要があると考えられた。
結論
食品由来感染症においても多国間に及ぶ広域流行が発生しており、我が国においても世界的に共通のプロトコールに基づくPFGE解析を一層普及させ、データの相互比較を可能にさせる必要がある。国内のシステムを充実させるための一手段として解析方法の技術的な精度管理が重要であるとともに、情報共有のための手段としてInternet利用の情報還元システムも推進すべきと考えられた。PFGE解析のネットワークの中核となる全国の地研が解析技術を維持し改良できるような組織的支援システムが求められている。
公開日・更新日
公開日
2006-04-10
更新日
-