文献情報
文献番号
200401341A
報告書区分
総括
研究課題名
小児科診療における効果的薬剤使用のための遺伝子多型スクリーニングシステムの構築に関する研究
課題番号
-
研究年度
平成16(2004)年度
研究代表者(所属機関)
小崎 健次郎(慶応義塾大学医学部)
研究分担者(所属機関)
- 谷川原祐介(慶応義塾大学医学部)
- 高橋孝雄(慶応義塾大学医学部)
- 山岸敬幸(慶応義塾大学医学部)
研究区分
厚生労働科学研究費補助金 疾病・障害対策研究分野 小児疾患臨床研究【若手医師・協力者活用等に要する研究】
研究開始年度
平成14(2002)年度
研究終了予定年度
平成16(2004)年度
研究費
28,726,000円
研究者交替、所属機関変更
-
研究報告書（概要版）
研究目的
小児科領域における臨床薬理遺伝学の研究・教育環境を充実を目的として、
① 薬理遺伝学的検査の実施における臨床データ利用の効率化、
② Hapmap計画データの有効活用による多型解析の効率化、
③ DHPLC法を用いたチオプリンメチル転移酵素（TPMT）遺伝子の全域スクリーニング、
④ 薬理遺伝学検査用マイクロプレートの最適化
という4プロジェクトを実施した。
① 薬理遺伝学的検査の実施における臨床データ利用の効率化、
② Hapmap計画データの有効活用による多型解析の効率化、
③ DHPLC法を用いたチオプリンメチル転移酵素（TPMT）遺伝子の全域スクリーニング、
④ 薬理遺伝学検査用マイクロプレートの最適化
という4プロジェクトを実施した。
研究方法
① 電子診療録から、抗癌剤の副作用発症に関する時系列データを系統的に抽出するプログラム・モジュールを開発した。
② 国際的な遺伝子多型情報が大規模に集積されているHapmap多型データベースデータを系統的に抽出するプログラム・モジュールを開発した。
③ DHPLC法を用いたTPMT遺伝子の全域スクリーニングを改良し、多民族由来の288名の正常対照のDNAを解析して、未報告の2種類のアミノ酸置換を同定した。
④ DHPLC法による遺伝子検査に於いて用いる「COPPER （Condition-Oriented-PCR primer-Embedded-Reactor）Plate」の作成を機械化する工程の最適化をおこなった。
② 国際的な遺伝子多型情報が大規模に集積されているHapmap多型データベースデータを系統的に抽出するプログラム・モジュールを開発した。
③ DHPLC法を用いたTPMT遺伝子の全域スクリーニングを改良し、多民族由来の288名の正常対照のDNAを解析して、未報告の2種類のアミノ酸置換を同定した。
④ DHPLC法による遺伝子検査に於いて用いる「COPPER （Condition-Oriented-PCR primer-Embedded-Reactor）Plate」の作成を機械化する工程の最適化をおこなった。
結果と考察
① 個人情報保護に十分留意しつつ、臨床データ（抗癌剤投与後の各種パラメータの時系列変化）を効率的に収集しうるプログラム・モジュールが開発された。
② 国際Hapmap計画によって公開されている膨大なデータから、研究対象とする薬物代謝酵素遺伝子についての正常人多型のデータを自動的に抽出し、ハプロタイプ構造を決定するプログラムへ送るプログラム・モジュールが開発された。
③ 6-メルカプトプリン治療前のTPMT全翻訳領域のスクリーニングが可能になった。
④ PCRプライマーを96ウェル形式に自動分注器により分注し、さらに風乾しておき、検査時に取り出してPCRすることが可能になった。検査受託時の検査室の負担が軽減された。
② 国際Hapmap計画によって公開されている膨大なデータから、研究対象とする薬物代謝酵素遺伝子についての正常人多型のデータを自動的に抽出し、ハプロタイプ構造を決定するプログラムへ送るプログラム・モジュールが開発された。
③ 6-メルカプトプリン治療前のTPMT全翻訳領域のスクリーニングが可能になった。
④ PCRプライマーを96ウェル形式に自動分注器により分注し、さらに風乾しておき、検査時に取り出してPCRすることが可能になった。検査受託時の検査室の負担が軽減された。
結論
臨床情報の安全かつ効率的な集積、国際規模のSNPs情報の簡便な利用、熱変性高速液体クロマトグラフィーによる迅速な検査体制の確立を通じて、小児科領域における薬理遺伝学研究の円滑な推進を図ることができた。
公開日・更新日
公開日
2005-05-12
更新日
-