文献情報
文献番号
201128127A
報告書区分
総括
研究課題名
ゲノム異常症としての歌舞伎症候群原因遺伝子同定と遺伝子情報に基づく成長障害治療可能性の研究開発
課題番号
H22-難治・一般-167
研究年度
平成23(2011)年度
研究代表者(所属機関)
吉浦 孝一郎(長崎大学 大学院医歯薬学総合研究科)
研究分担者(所属機関)
- 木下 晃(長崎大学 大学院医歯薬学総合研究科)
- 新川 詔夫(北海道医療大学 学長)
- 太田 亨(北海道医療大学 個体差健康科学研究所)
研究区分
厚生労働科学研究費補助金 疾病・障害対策研究分野 難治性疾患克服研究
研究開始年度
平成22(2010)年度
研究終了予定年度
平成23(2011)年度
研究費
10,000,000円
研究者交替、所属機関変更
-
研究報告書(概要版)
研究目的
歌舞伎症候群は,平成21年には未だ原因不明であった。本研究の目的は (1) 歌舞伎症候群の原因遺伝子同定と病態生理の解明,(2) 病態生理,分子病態にもとづいた歌舞伎症候群の症状,特に出生後成長障害,女児の思春期早発の治療方針策定の基礎データを得ること,(3)全国の公立病院小児科,整形外科,精神科等へ歌舞伎症候群患者の有無や試料提供の意思等を調査し,小児科管理から離れた成人歌舞伎症候群の患者情報,変異情報を統合することを目的とした。
研究方法
新規・既収集試料に関して次世代シーケンサーを用いたampliconシーケンス解析とキャピラリー塩基配列決定による変異解析を行った。その後,遺伝子変異の詳細と臨床症状との関連を明らかにする。また,変異の見つからない症例に関しては,両親と患児を対象にexome解析をおこないMLL2遺伝子とは異なる歌舞伎症候群原因遺伝子の探索を行った。
結果と考察
合計53例の歌舞伎症候群患者の変異スクリーニングの結果,33名が変異有りと認定し,20名を変異なしとした。歌舞伎症候群内でのMLL2変異陽性率は33/53 = 62% であった。SOLiD5500のscreeningから見た変異解析について,全てキャピラリーシーケンサーによって確認作業を行い次の様な正誤の割合となった。SNV52個 -(真23個,偽29個), Ins28個 -(真1個,偽27個), Del9個 -(真2個,偽7個)。
次ぎに,全例塩基配列確認をおこなったexon39とexon48に存在した変異は12例であった。単純塩基置換が9例,insertion/deletionが3例であった。単純塩基置換が9例のうち2例はSOLiD5500のscreening workflowによって見落とされていた。insertion/deletion 3例においてはSOLiD5500を使用したworkflowでは全て見落されていた。
次ぎに,全例塩基配列確認をおこなったexon39とexon48に存在した変異は12例であった。単純塩基置換が9例,insertion/deletionが3例であった。単純塩基置換が9例のうち2例はSOLiD5500のscreening workflowによって見落とされていた。insertion/deletion 3例においてはSOLiD5500を使用したworkflowでは全て見落されていた。
結論
歌舞伎症候群患者でのMLL2遺伝子の変異発見率は70?80%と考えられる。次世代シーケンサーでのampliconシーケンス法では,特に短い範囲の塩基欠失/挿入は見落としている可能性が認められた。当初目標として掲げた,phnotype-genotype corelationを明らかにし,成長障害にいたる病態解明とそれに基づく治療可能性の探求までには至らなかった
患者情報収集・アンケート調査を行う。アンケート対象は全国公立病院の小児科,整形外科,精神科等を対象とし,全国の患者数調査を行う予定としたが,行う事が出来なかった。
患者情報収集・アンケート調査を行う。アンケート対象は全国公立病院の小児科,整形外科,精神科等を対象とし,全国の患者数調査を行う予定としたが,行う事が出来なかった。
公開日・更新日
公開日
2013-03-28
更新日
-