ゲノム・エピゲノム解析に基づく刷り込み疾患Beckwith-Wiedemann症候群の診断基準作成と治療法開発基盤の確立

文献情報

文献番号

201024215A

報告書区分

総括

研究課題名

ゲノム・エピゲノム解析に基づく刷り込み疾患Beckwith-Wiedemann症候群の診断基準作成と治療法開発基盤の確立

課題番号

H22-難治・一般-160

研究年度

平成22(2010)年度

研究代表者(所属機関)

副島　英伸(佐賀大学　医学部　分子生命科学講座)

研究分担者(所属機関)

東元　健(佐賀大学　医学部　分子生命科学講座)
吉浦　孝一郎(長崎大学大学院医歯薬学総合研究科)
秦　健一郎(国立成育医療センター研究所)

研究区分

厚生労働科学研究費補助金疾病・障害対策研究分野難治性疾患克服研究

研究開始年度

平成22(2010)年度

研究終了予定年度

平成23(2011)年度

研究費

15,000,000円

研究者交替、所属機関変更

-

研究報告書（概要版）

研究目的

Beckwith-Wiedemann症候群（BWS）のゲノム・エピゲノム解析を通じて刷り込み異常の原因を明らかにし、マウスiPSC、患者iPSCの解析により刷り込み調節機構を解明することを目的とした。

研究方法

佐賀大学医学部倫理委員会、遺伝子・ゲノム解析倫理委員会の承認のもと実施した。BWS関連疾患231例のうち、3種類の診断基準のいずれかを満たすのは184例で、うち107例について既知のゲノム・エピゲノム変異を解析した。今後の解析技術基盤としてSNP arrayによるUPD解析法、MALDI-TOF-MSによる刷り込みDMRのメチル化解析法を確立した。マウスiPSCの刷り込みDMRのメチル化解析を行った。低血糖例について糖尿病関連遺伝子の変異解析を行った。KvDMR1脱メチル化患者で見られた欠失領域について、他症例を次世代シークエンサーで解析した。bio-COBRA法とillumina社infiniumアッセイでゲノムワイドなメチル化解析を行った。

結果と考察

三主徴すべてを示す頻度は低いこと、生殖補助医療出生児の割合は欧米と同等であること、合併腫瘍では肝原発腫瘍が4割を占めること、10才以上での腫瘍発生があること、IGF2高発現が腫瘍リスクであること、などが明らかとなった。マウスiPSCの解析では、クローン間でメチル化状態が異なることがわかった。患児iPSCは作製中である。低血糖の原因としてKCNJ11、ABCC8、INSの変異は否定的であった。次世代シークエンサーを用いた解析では、coding領域での変異は認められず、数百bpレベルのindelも見いだせなかった。bio-COBRAで解析では、KvDMR1脱メチル化10例中2例で他の座位のメチル化異常を認め、H19DMR高メチル化2例でIGF2遺伝子内の高メチル化を認めた。infiniumアッセイ解析では顕著なDNAメチル化異常は存在しなかった。

結論

本邦例の臨床像とゲノム・エピゲノム異常の頻度と特徴を明らかにした。マウスiPSCでは、クローン間でメチル化状態が異なることを見いだした。今年度確立した各種の網羅的ゲノム・エピゲノム解析法を駆使したBWS症例の解析およびマウスiPSCおよび患者由来iPSCの解析により、ゲノム刷り込みの機構の本質を解明しBWSの予防法・治療法の開発基盤の確立を目指す。