文献情報
文献番号
201010010A
報告書区分
総括
研究課題名
疾患関連創薬バイオマーカー探索研究
課題番号
H20-バイオ・指定-005
研究年度
平成22(2010)年度
研究代表者(所属機関)
山西 弘一(独立行政法人 医薬基盤研究所 なし)
研究分担者(所属機関)
- 朝長 毅(独立行政法人 医薬基盤研究所)
- 角田 慎一(独立行政法人 医薬基盤研究所)
- 仲 哲治(独立行政法人 医薬基盤研究所)
- 中山 敬一(九州大学 生体防御医学研究所)
- 平野 久(横浜市立大学院 国際総合科学研究科)
- 尾野 雅哉(独立行政法人 国立がんセンター研究所)
- 寒川 賢治(独立行政法人 国立循環器病センター研究所)
- 南野 直人(独立行政法人 国立循環器病センター研究所)
- 高坂 新一(独立行政法人 国立精神・神経センター 神経研究所)
- 加藤 菊也(独立行政法人 大阪府立病院機構 大阪成人病センター)
- 野村 文夫(千葉大学大学院 医学研究院)
- 荒木 令江(熊本大学大学院 生命科学研究部)
- 中村 和行(山口大学大学院 医学系研究科)
研究区分
厚生労働科学研究費補助金 厚生科学基盤研究分野 創薬基盤推進研究(創薬バイオマーカー探索研究)
研究開始年度
平成20(2008)年度
研究終了予定年度
平成24(2012)年度
研究費
289,632,000円
研究者交替、所属機関変更
-
研究報告書(概要版)
研究目的
本研究は、疾患関連たんぱく質解析研究を総合的に推進していくため、疾患組織・細胞などの臨床検体から、疾患関連たんぱく質の探索・同定と、その中から医薬品シーズ・創薬ターゲットとなり得るたんぱく質の絞り込みを効果的かつ効率的に行い、疾患の予防・治療・診断方法の確立や画期的医薬品の開発に資することを目的とする。
研究方法
1.iTRAQ法によるタンパク質の定量比較解析法
2.リン酸化タンパク質
3.細胞膜タンパク質解析法
4.血管プロテオミクス法
5.血清・血漿・髄液等体液の前処理法
6.2DICAL法
7.抗体プロテオミクス手法(ファージ抗体ライブラリー技術)
8.超高感度自己抗体検出法
9.PROTEOMEX技術によるバイオマーカー抽出法
10.SRM/MRMを用いたタンパク質定量法
11.プロテオーム解析とトランスクリプトーム解析融合による統合プロテオミクス
12.糖鎖構造の高精度・高感度検出法
2.リン酸化タンパク質
3.細胞膜タンパク質解析法
4.血管プロテオミクス法
5.血清・血漿・髄液等体液の前処理法
6.2DICAL法
7.抗体プロテオミクス手法(ファージ抗体ライブラリー技術)
8.超高感度自己抗体検出法
9.PROTEOMEX技術によるバイオマーカー抽出法
10.SRM/MRMを用いたタンパク質定量法
11.プロテオーム解析とトランスクリプトーム解析融合による統合プロテオミクス
12.糖鎖構造の高精度・高感度検出法
結果と考察
上記のプロテオミクス技術を用いて、以下のバイオマーカー候補タンパク質を同定した。またそれらの候補タンパク質の検証のためのSRM/MRM法を確立した。
1.アルツハイマー病の早期診断マーカーペプチドAPL1β25,27,28。
2.卵巣明細胞腺癌由来の分泌タンパク質10種類以上。
3.関節リウマチ活動性マーカーleucine rich alpha-2 glycoprotein。
4.難治性乳癌バイオマーカー候補Ephrin receptor A10が。
5.大腸癌、膵臓癌新規癌特異的糖鎖構造ST1H。
6.肝癌バイオマーカーHSP70, Mn-SOD、抗Peroxiredoxin 6自己抗体
7.脳腫瘍と多発性骨髄腫の薬剤耐性シグナル分子群のネットワークの抽出。
1.アルツハイマー病の早期診断マーカーペプチドAPL1β25,27,28。
2.卵巣明細胞腺癌由来の分泌タンパク質10種類以上。
3.関節リウマチ活動性マーカーleucine rich alpha-2 glycoprotein。
4.難治性乳癌バイオマーカー候補Ephrin receptor A10が。
5.大腸癌、膵臓癌新規癌特異的糖鎖構造ST1H。
6.肝癌バイオマーカーHSP70, Mn-SOD、抗Peroxiredoxin 6自己抗体
7.脳腫瘍と多発性骨髄腫の薬剤耐性シグナル分子群のネットワークの抽出。
結論
昨年度確立した次世代プロテオミクス基盤技術を用いてヒト臨床検体を用いた大規模なバイオマーカー候補タンパク質の探索を行った。その結果、上記の新規バイオマーカー候補タンパク質の同定に成功した。また、バイオマーカー候補タンパク質の絞込みや検証を行うためのSRM/MRM法を確立し、臨床応用を試みた。
公開日・更新日
公開日
2011-05-30
更新日
-