食品由来感染症の病原体解析の手法及び病原体情報の共有に関する研究

文献情報

文献番号
202318001A
報告書区分
総括
研究課題名
食品由来感染症の病原体解析の手法及び病原体情報の共有に関する研究
研究課題名(英字)
-
課題番号
21HA1001
研究年度
令和5(2023)年度
研究代表者(所属機関)
泉谷 秀昌(国立感染症研究所 細菌第一部)
研究分担者(所属機関)
-
研究区分
厚生労働科学研究費補助金 疾病・障害対策研究分野 新興・再興感染症及び予防接種政策推進研究
研究開始年度
令和3(2021)年度
研究終了予定年度
令和5(2023)年度
研究費
14,760,000円
研究者交替、所属機関変更
-

研究報告書(概要版)

研究報告書(PDF)

研究報告書(紙媒体)

文献情報

文献番号
202318001B
報告書区分
総合
研究課題名
食品由来感染症の病原体解析の手法及び病原体情報の共有に関する研究
研究課題名(英字)
-
課題番号
21HA1001
研究年度
令和5(2023)年度
研究代表者(所属機関)
泉谷 秀昌(国立感染症研究所 細菌第一部)
研究分担者(所属機関)
-
研究区分
厚生労働科学研究費補助金 疾病・障害対策研究分野 新興・再興感染症及び予防接種政策推進研究
研究開始年度
令和3(2021)年度
研究終了予定年度
令和5(2023)年度
研究者交替、所属機関変更
-

研究報告書(概要版)

研究報告書(PDF)

研究報告書(紙媒体)

行政効果報告

文献番号
202318001C

成果

専門的・学術的観点からの成果
食品由来感染症における病原体サーベイランスの基盤整備を行うため、分子疫学解析手法及び病原体情報の共有に関する検討を行った。2018年に国内のEHEC病原体解析において統一手法となったMLVA法の技術研修及び精度管理を行い、地方衛生研究所における同法への理解、検査体制の普及、向上に努めた。従来法であるPFGE及びISPS法についても精度管理を実施し検査体制の維持に努めた。病原体情報についてデータベースを構築し、オンラインでMLVA型を付与するMLVAシステムの検討、構築、改良を進めた。
臨床的観点からの成果
毎年流行を繰り返し、血便・溶血性尿毒症症候群などの重症合併症を引き起こす腸管出血性大腸菌感染症に対し、MLVA法を用いてその起因菌を迅速に型別し、共有できるシステムの構築を行った。
ガイドライン等の開発
腸管出血性大腸菌の分子疫学解析に用いる、MLVA法の結果の共有にあたり、よく使われるminimum spanning tree作図ソフトについて、マニュアル案を作成した。MLVA法で得られた結果から型名を付与するためのオンラインシステム、MLVAシステムの環境整備を行った。
その他行政的観点からの成果
2018年6月29日に厚生労働省から発出された事務連絡「腸管出血性大腸菌による広域的な感染症・食中毒に関する調査について」(2023年6月28日再周知)にかかるMLVA法の普及に貢献した。定期的にMLVAの情報をまとめ、厚生労働省と情報共有を行い、また、食品保健総合情報処理システム(NESFD)に情報提供を行った。腸管出血性大腸菌による全国的な流行状況について、分子疫学的観点から共通性が見られる事例(クラスター)について逐次情報提供を行った。
その他のインパクト
衛生微生物協議会、学会等で、食品由来感染症における分子疫学解析の状況について発表等を行った。MLVA法の理解および技術普及のため種々の研修に協力した。

発表件数

原著論文(和文)
9件
原著論文(英文等)
4件
その他論文(和文)
1件
その他論文(英文等)
0件
学会発表(国内学会)
14件
学会発表(国際学会等)
1件
その他成果(特許の出願)
0件
その他成果(特許の取得)
0件
その他成果(施策への反映)
1件
事務連絡「腸管出血性大腸菌による広域的な感染症・食中毒に関する調査について」(2023年6月28日再周知)
その他成果(普及・啓発活動)
5件
研修会5件

特許

主な原著論文20編(論文に厚生労働科学研究費の補助を受けたことが明記された論文に限る)

論文に厚生労働科学研究費の補助を受けたことが明記された論文に限ります。

原著論文1
Hirai S, Yokoyama E, Ando N, et al.
Another advantage of multi-locus variable-number tandem repeat analysis that can putatively subdivide enterohemorrhagic Escherichia coli O157 strains into clades by maximum a posteriori estimation.
PLoS One. , 18 , e0283684-  (2023)
10.1371/journal.pone.0283684
原著論文2
Wakabayashi Y, Harada T, Kawai T, et al.
Multilocus variable-number tandem-repeat analysis of enterohemorrhagic Escherichia coli serogroups O157, O26, and O111 based on a de novo look-up table constructed by regression analysis.
Foodborne Pathog Dis. , 18 , 647-654  (2021)
10.1089/fpd.2020.2921
原著論文3
Lee K, Iguchi A, Terano C, et al.
Combined usage of serodiagnosis and O antigen typing to isolate Shiga toxin-producing Escherichia coli O76:H7 from a hemolytic uremic syndrome case and genomic insights from the isolate.
Microbiology spectrum , 12 , e0235523-  (2024)
10.1128/spectrum.02355-23

公開日・更新日

公開日
2025-05-23
更新日
2026-06-09

収支報告書

文献番号
202318001Z