疾患多発家系集積データと大規模ジェノタイピングを併用した新規糖尿病発症原因遺伝子の同定とテーラーメード医療への応用

文献情報

• 文献番号: 200907014A
• 報告書区分: 総括
• 研究課題名: 疾患多発家系集積データと大規模ジェノタイピングを併用した新規糖尿病発症原因遺伝子の同定とテーラーメード医療への応用
• 課題番号: H20-ゲノム・一般-007
• 研究年度: 平成21(2009)年度
• 研究代表者(所属機関): 稲垣 暢也(京都大学医学研究科 糖尿病・栄養内科学)

研究分担者(所属機関)

• 長嶋　一昭(京都大学医学研究科　)
• 小泉　昭夫(京都大学医学研究科　　)
• 松田　文彦(京都大学情報学研究科)
• 池田　正毅(正名会池田病院)
• 岡本　元純(大津赤十字病院)
• 矢野　秀樹(彦根市立病院)
• 山本　泰三(社会福祉法人京都社会事業財団京都桂病院)
• 水野　展寿(滋賀県立成人病センター)
• 安田　浩一朗(大阪府済生会野江病院)

• 研究区分: 厚生労働科学研究費補助金 厚生科学基盤研究分野 創薬基盤推進研究（ヒトゲノムテーラーメード研究）
• 研究開始年度: 平成20(2008)年度
• 研究終了予定年度: 平成22(2010)年度
• 研究費: 36,759,000円
• 研究者交替、所属機関変更: -

研究報告書（概要版）

研究目的

代表的生活習慣病である糖尿病の発症には遺伝因子と環境因子が関与し、発症感受性遺伝子の多くは未同定のままである。本研究は、糖尿病家族歴濃厚家系を集積した上でゲノム解析を行い、効率的に糖尿病感受性遺伝子の絞り込みを行い、日本人コホートを用いた検証を行うことにより糖尿病感受性遺伝子を同定することを目的とする。

研究方法

（1）昨年度に引き続き、3世代以上にわたり糖尿病患者を有する糖尿病家族歴濃厚家系を当院および協力病院で集積し、研究参加承諾を得て臨床情報および検体の収集を行った。
（2）全ゲノム連鎖解析、ハプロタイプ解析により候補領域の絞り込みを行い、領域内に存在する遺伝子に関して、データベース用いた候補遺伝子順位付けを行い、塩基配列決定を行った。
（3）候補遺伝子の日本人における検証作業のためコホートの整備を進めた。
（4）ゲノム解析で絞り込まれた候補遺伝子における変異に関して、日本人コホートを用いたCase-control解析を行い、糖尿病感受性遺伝子としての検証を行った。

結果と考察

現時点までに、糖尿病家族歴濃厚患者（家系）を累計約200人（54家系）以上集積した。12家系で連鎖解析が完了した。解析が先行している遺伝形式明確な4家系でのゲノム解析により、候補遺伝子領域を23Mbにまで絞り込み、領域内に存在する約190個の遺伝子に関し、Endeavourにより候補遺伝子順位付けを行った。最もスコアが高かったglucokinase regulatory protein遺伝子（GCKR）に関して、プロモーター領域およびエクソン領域の配列決定を行い、稀なSNPsが一般人口に比して家系で有意に多発することを明らかにし、1家系において、GCKRの稀なSNPが疾患の有無と一致することを見いだした。コホートデータの集積に関して、ながはまコホート事業では約6000名、秋田県能代市コトートでは約3500名、岐阜県丹生川村コホートでは約1500名のデータが集積された。岐阜県旧丹生川村のコホートを用いた解析から、HbA1Cの上昇とGCKRの多型に有意な関連を見いだした。以上から、GCKRは、糖尿病発症との関連が強く示唆された。

結論

糖尿病家族歴濃厚患者（家系）を累計約200人（54家系）以上集積し、コホートの整備を進めた。ゲノム解析により、糖尿病感受性遺伝子GCKRを絞り込んだ。

公開日・更新日

• 公開日: 2011-05-30
• 更新日: -