文献情報
文献番号
202024015A
報告書区分
総括
研究課題名
食品由来薬剤耐性菌のサーベイランスのための研究
課題番号
H30-食品-一般-006
研究年度
令和2(2020)年度
研究代表者(所属機関)
渡辺 治雄(国立感染所研究所 細菌第一部)
研究分担者(所属機関)
- 四宮 博人(愛媛県立衛生環境研究所)
- 菅井 基行(国立感染症研究所薬剤耐性研究センター)
- 大西 真(国立感染症研究所)
- 朝倉 宏(国立医薬品食品衛生研究所 食品衛生管理部)
- 小澤 真名緒(農林水産省 動物医薬品検査所 検査第二部)
- 小西 典子(東京都健康安全研究センター 微生物部 食品微生物研究科)
- 富田 治芳(群馬大学大学院医学系研究科 生体防御機構学 細菌学分野)
- 浅井 鉄夫(岐阜大学大学院連合獣医学研究科)
- 石井 良和(東邦大学 医学部 微生物・感染症学講座)
研究区分
厚生労働科学研究費補助金 健康安全確保総合研究分野 食品の安全確保推進研究
研究開始年度
平成30(2018)年度
研究終了予定年度
令和2(2020)年度
研究費
36,501,000円
研究者交替、所属機関変更
-
研究報告書（概要版）
研究目的
AMR National Action Plan(NAP)では、ヒト、動物（家畜含）、食品、環境を含めたワンヘルス・アプローチによる薬剤耐性サーベイランス体制の構築が掲げられている。食品等から菌の分離を行っている地方衛生研究所のネットワークを活用することにより、鶏肉等の食材から分離された各菌の耐性結果をJANIS-JVARMの解析ソフトの中に取り込み、総合的に解析し比較検討できるようにする。その結果を、国内・国外へ情報発信する。国内においては、「薬剤耐性ワンヘルス動向調査年次報告書」に、国外においてはWHO GLASSに報告する。
研究方法
① 地方衛生研究所を主とする食品由来菌耐性サーベイランス：サルモネラ、病原大腸菌、カンピロバクターについて、これまでに確立したプロトコルにしたがって、CLSIディスク拡散法による薬剤感受性検査を実施した。
② 家畜―食品―人由来耐性菌のデータの比較解析：上記によって分離された全食品由来菌株の耐性率データを、既に作成している相互変換ソフトを用いて、JANIS（臨床由来株）およびJVARM（家畜由来株）とのデータベースの中に取り込む。それにより動物、食品、ヒトから分離された耐性菌の動向を相互比較した。
③ 遺伝子レベルの解析：分離された人、家畜、食品由来株の薬剤耐性菌／耐性遺伝子の詳細を短鎖型シークエンサーであるMiniSeq/MiSeq/HiSeq/NovaSeqシステム、長鎖型シークエンサーであるMinION を併用して解析した。完全ゲノム配列、およびプラスミドの配列の比較解析を行った。
④ 健康者由来薬剤耐性大腸菌出現状況の把握：健康者糞便由来大腸菌について薬剤感受性試験を行い，耐性菌保持状況を把握した。
② 家畜―食品―人由来耐性菌のデータの比較解析：上記によって分離された全食品由来菌株の耐性率データを、既に作成している相互変換ソフトを用いて、JANIS（臨床由来株）およびJVARM（家畜由来株）とのデータベースの中に取り込む。それにより動物、食品、ヒトから分離された耐性菌の動向を相互比較した。
③ 遺伝子レベルの解析：分離された人、家畜、食品由来株の薬剤耐性菌／耐性遺伝子の詳細を短鎖型シークエンサーであるMiniSeq/MiSeq/HiSeq/NovaSeqシステム、長鎖型シークエンサーであるMinION を併用して解析した。完全ゲノム配列、およびプラスミドの配列の比較解析を行った。
④ 健康者由来薬剤耐性大腸菌出現状況の把握：健康者糞便由来大腸菌について薬剤感受性試験を行い，耐性菌保持状況を把握した。
結果と考察
① 耐性菌のデータの国内・国外への発信：国内においては、「薬剤耐性ワンヘルス動向調査年次報告書2020」、国外においてはWHOのGLASSに報告した:
② 地方衛生研究所（地研、全国23の地研が参加）を中心にした食品由来株の耐性菌サーベイランス；2020年分離のサルモネラについて血清型別の詳細な解析を行った。ヒト由来株のうち食品からも分離された血清型、S. Infantis, S. Schwarzengrund, S. Manhattanではヒト由来株と食品由来株の耐性傾向に強い類似性があり、食品由来耐性菌とヒト由来耐性菌との関連性が強く示唆された。
③ サルモネラについては、ESBL産生遺伝子では、ヒト由来株、食品由来株とも、CTX-M-1グループの保有が最も多く、TEM型が次に多かった。一方、大腸菌では、CTX-M-9グループ, CTX-M-2グループ, TEM型が多く検出された。
④ コリスチン耐性遺伝子の検出：ヒト由来サルモネラからmcr-1グループ（2株）、食品由来サルモネラからmcr-5（1株）が、それぞれ検出された。動物由来大腸菌では、mcr-1及びmcr-5遺伝子が確認された。コリスチンの家畜への飼料添加剤としての使用は我が国では止められている。すでに存在しているコリスチン耐性遺伝子が今後どのように変遷していくのかを追跡する必要がある。
⑤ 市販鶏肉由来大腸菌の薬剤耐性菌出現状況：セファロスポリン系薬剤耐性率は国産由来1.0％，外国産由来3.5％であった。
⑥ 健康者糞便由来大腸菌の薬剤耐性菌出現状況：フルオロキノロン系薬剤耐性は6.4％，セファロスポリン系薬剤耐性は4.6％、mcr保有株は0.48％であった。
② 地方衛生研究所（地研、全国23の地研が参加）を中心にした食品由来株の耐性菌サーベイランス；2020年分離のサルモネラについて血清型別の詳細な解析を行った。ヒト由来株のうち食品からも分離された血清型、S. Infantis, S. Schwarzengrund, S. Manhattanではヒト由来株と食品由来株の耐性傾向に強い類似性があり、食品由来耐性菌とヒト由来耐性菌との関連性が強く示唆された。
③ サルモネラについては、ESBL産生遺伝子では、ヒト由来株、食品由来株とも、CTX-M-1グループの保有が最も多く、TEM型が次に多かった。一方、大腸菌では、CTX-M-9グループ, CTX-M-2グループ, TEM型が多く検出された。
④ コリスチン耐性遺伝子の検出：ヒト由来サルモネラからmcr-1グループ（2株）、食品由来サルモネラからmcr-5（1株）が、それぞれ検出された。動物由来大腸菌では、mcr-1及びmcr-5遺伝子が確認された。コリスチンの家畜への飼料添加剤としての使用は我が国では止められている。すでに存在しているコリスチン耐性遺伝子が今後どのように変遷していくのかを追跡する必要がある。
⑤ 市販鶏肉由来大腸菌の薬剤耐性菌出現状況：セファロスポリン系薬剤耐性率は国産由来1.0％，外国産由来3.5％であった。
⑥ 健康者糞便由来大腸菌の薬剤耐性菌出現状況：フルオロキノロン系薬剤耐性は6.4％，セファロスポリン系薬剤耐性は4.6％、mcr保有株は0.48％であった。
結論
食品由来耐性菌の耐性動向調査体制として地方衛生研究所を中心としたネットワークを活用し、サルモネラ、カンピロバクターの耐性菌の状況を把握できるようになった。それらの結果を、「薬剤耐性ワンヘルス動向調査年次報告書2020」に、国外においてはWHO GLASSに報告し、情報発信に貢献した。
公開日・更新日
公開日
2021-10-18
更新日
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