文献情報
文献番号
200638019A
報告書区分
総括
研究課題名
化学物質リスク評価の基盤整備におけるトキシコゲノミクスの利用に関する研究－反復暴露影響及び多臓器連関性（発達過程を含む）に重点を置いた解析研究－
課題番号
H18-化学-一般-001
研究年度
平成18(2006)年度
研究代表者(所属機関)
菅野 純(国立医薬品食品衛生研究所安全性生物試験研究センター毒性部)
研究分担者(所属機関)
- 北嶋 聡(国立医薬品食品衛生研究所安全性生物試験研究センター毒性部 )
- 井上 達(国立医薬品食品衛生研究所安全性生物試験研究センター)
- 北川 昌伸(東京医科歯科大学医歯学総合研究科包括病理学分野)
- 漆谷 徹郎(同志社女子大学薬学部病態生理学教室)
- 本間 正充(国立医薬品食品衛生研究所安全性生物試験研究センター変異遺伝部)
- 池田通(長崎大学大学院医歯薬学総合研究科)
- 相崎健一(国立医薬品食品衛生研究所安全性生物試験研究センター毒性部 )
研究区分
厚生労働科学研究費補助金 健康安全確保総合研究 化学物質リスク研究
研究開始年度
平成18(2006)年度
研究終了予定年度
平成20(2008)年度
研究費
95,760,000円
研究者交替、所属機関変更
-
研究報告書（概要版）
研究目的
本研究は化学物質リスク評価の基盤整備としての安全性評価システム構築に、網羅的な遺伝子発現変化解析法を適用するものである。先の研究にて構築済みの単回（急性）暴露によるマウス肝の初期応答トキシコゲノミクス・データベースに、反復（慢性）暴露実験からの情報、多臓器間の連関情報、及び、in situ hybridizationによる臓器内の遺伝子発現部位の可視化情報を加え、更なる充実を図ると共に、毒性学的意味付けを膨大なゲノミクス情報から取り出すためのインフォマティクス技術開発を平行して進める。これにより、従来以上に迅速、定量的且つ高精度な評価システムの構築を目指す。
研究方法
研究班はデータベース（DB）生成研究、基盤研究、トキシコゲノミクスのためのインフォマティクス開発研究の3部構成とする。DB生成研究では、マウスを用い、１）新型慢性暴露、２）多臓器間連関性、３）ハイスループットin situ hybridization（HS-ISH）DBを構築する。基盤研究では発生毒性、免疫毒性、造血毒性、消化管毒性、骨毒性、遺伝子傷害毒性を取り上げる。インフォマティクス開発研究では、主任研究者らが構築した遺伝子発現値の絶対値化手法であるPercellome手法に基礎を置くMillefeuille data（ミルフィーユデータ）システムの改良、大量データから生物学的有意な情報を効率的に抽出する方法の開発・検証を実施する。
結果と考察
DB生成研究では新型慢性暴露実験、多臓器間連関性についてデータ取得のための化合物暴露実験系整備を完了し、DB生成を開始した。HS-ISHはシステムの自動化に目処がついた。基盤研究では各班員の実験系を網羅的遺伝子発現解析に対応させるための条件設定を行い、次年度以降の研究体制整備を完了した。インフォマティクス開発研究では発現同期遺伝子の抽出・解析技術の開発・改良、Exonレベルでの遺伝子発現データの解析技術開発、プラットフォーム間データ変換の検証を行った。
結論
DB生成研究では、DB生成を予定に沿って開始し、HS-ISHシステムは自動化に目処をつけるなど、いずれも順調に推移した。基盤研究では次年度以降に網羅的遺伝子発現解析手法を適用可能な状況となった。インフォマティクス開発研究ではトキシコゲノミクスのためのデータ変換技術や高次解析アルゴリズムの開発など、応用研究のための基礎となる成果を得た。
公開日・更新日
公開日
2007-04-10
更新日
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