文献情報
文献番号
200614090A
報告書区分
総括
研究課題名
DNAマイクロアレイによる多発性硬化症の迅速診断法の樹立に関する研究
課題番号
H17-創薬-001
研究年度
平成18(2006)年度
研究代表者(所属機関)
佐藤 準一(明治薬科大学薬学部バイオインフォマティクス)
研究分担者(所属機関)
- 山村 隆(国立精神・神経センター神経研究所・疾病研究第六部)
- 齋藤 俊郎((株)日立製作所ライフサイエンス推進事業部遺伝子診断事業推進センター)
- 荒浪 利昌(国立精神・神経センター神経研究所・免疫研究部)
研究区分
厚生労働科学研究費補助金 厚生科学基盤研究分野 政策創薬総合研究
研究開始年度
平成17(2005)年度
研究終了予定年度
平成18(2006)年度
研究費
10,000,000円
研究者交替、所属機関変更
-
研究報告書(概要版)
研究目的
多発性硬化症(multiple sclerosis; MS)は中枢神経系に炎症性脱髄巣が多発し再発を繰り返す難病である。自己抗原反応性Th1細胞が血液脳関門を通過して炎症性脱髄を惹起する。通常の血液検査では異常を認めず診断は容易ではない。早期治療開始のために高精度迅速診断法の樹立が必須である。DNAマイクロアレイは遺伝子発現を網羅的・系統的・包括的に解析出来、ポストゲノム創薬で必須の研究手法である。本研究では自己反応性活性化T細胞を含む末梢血T細胞のDNAマイクロアレイ解析によるMS迅速診断法確立を目的とする。平成18年度は平成17年度に樹立したMS病型分類データベース(MS classification database; MSCD)を基にMS特異的遺伝子群(MS-diagnostic genes; MDG)を抽出、診断法を開発、精度を検証した。
研究方法
MSCD上で健常者(Nc)に最も類似する遺伝子発現プロフィールを呈するMSサブグループMS-AとNc間で発現差異を呈する遺伝子群(MDG)を絞り込み、サポートベクターマシン(SVM)解析と階層的クラスター解析(HCA)によるMS診断法を開発、新規129症例を解析、臨床診断と対比して精度を検証、KeyMolnetでMDGの分子ネットワークを解析した。また再発寛解型MS患者(n = 6)では経過を追跡して再発期と寛解期で発現差異を認める遺伝子群(relapse-specific genes; RSG)を同定した。
結果と考察
58 MDGを抽出、Myc/Mad, p63を介する制御系の関与を見出した。McDonald診断基準を満たすMS 95例とnon-MS 15例に関し、58 MDGを指標とするHCAとMSCDを機械学習したSVMを施行、採血から最短3日以内に結果を得た。正答率はHCA 30.9%, SVM 32.7%, 偽陰性率はHCA 70.5%, SVM 71.6%, 偽陽性率はHCA 60.0%, SVM 40.0%。43 RSGを同定、MS再発時のNF-kB発現制御系異常を見出した。
結論
HCA, SVMに基づくMS迅速診断法を開発し、病態に深く関与する転写因子系ネットワークを解明出来た。現時点でマイクロアレイ診断法単独では誤診率が高く臨床応用に直結しない。今後、指標遺伝子やSVM解析パラメーターを変えて、臨床情報(時間的・空間的多発性)との組み合わせで精度を向上を目指す。
公開日・更新日
公開日
2007-04-06
更新日
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